При этом родители должны выбрать направленность этого курса. В теории, каждая школа обязана обеспечить преподавание нескольких модулей, в рамках которых дети могут изучать светскую этику, основы православия, ислама, буддизма, мусульманства. Однако, по мнению представителей епархии Санкт-Петербурга, в ряде городских школ родители не имеют возможности осуществить выбор: им навязывают изучение светской этики, под разными предлогами отказывая в возможности получения знаний о православной религии.

Представители церкви заявляют: в некоторых школах Санкт-Петербурга не проводятся собрания для родителей, а их мнение практически не учитывается при выборе модуля. Церковнослужители критикуют содержание курсов «Основы мировых религий» и «Основы светской этики», считая, что они не позволяют воспитать полноценную и нравственную личность.

По мнению представителей епархии, от позиции церкви во многом зависит создание условий для полноценного выбора содержания будущего курса.